在少年三国志的后期阶段，武将阵容的搭配需要兼顾爆发、控制和续航能力。马超作为核心输出武将，搭配千幻左慈、闭月貂蝉等辅助型角色，能形成高爆发阵容，其物理与法术混合伤害可快速击溃敌方后排。耀武华雄和陷阵高顺则提供前排承伤与防御加成，确保队伍稳定性。这类阵容尤其适合应对缺乏全体防御的对手，通过控制链与爆发伤害的配合实现速战速决。
蜀国赤金阵容在后期表现突出，赤金赵云和赤金张飞为核心，配合庞统的回怒机制实现持续输出。赵云的高爆发与张飞的反击能力形成攻防一体，庞统的怒气回复则保证技能循环流畅。该阵容对高频攻击或控制型队伍有显著克制效果，通过反击机制消耗敌方战力。吴国灼烧队则以赤金周瑜、紫金鲁肃为核心，依赖灼烧效果叠加伤害，孙坚和太史慈的斩杀能力可在敌方半血时完成收割，周瑜的群体控制与鲁肃的治疗进一步强化持久战能力。
群雄阵营的吕布、貂蝉组合是后期热门选择，吕布的单体爆发配合貂蝉的控制可快速瓦解敌方核心。华佗的加入为阵容提供治疗支持，延长生存时间，而左慈的幻术技能能扰乱敌方阵型。若追求属性加成，可替换张角为袁绍，但需注意袁绍的辅助效果更偏向团队增益而非直接输出。这类阵容依赖先手优势，需优先提升吕布的速度与暴击属性。
魏国后期阵容以曹操、司马懿为战术核心，曹操的群体控制与司马懿的减益效果形成压制链。张辽的突袭能力可针对敌方后排，郭嘉的群体治疗和增益则维持队伍状态。典韦作为副坦提供嘲讽保护，而荀彧的BUFF能加速怒气积累，确保技能释放频率。该阵容对装备和战魂要求较高，需优先为曹操配置不动如山战魂以增强抗暴能力。
混搭阵容在后期具有较高灵活性，例如将蜀国庞统与群雄贾诩结合，利用庞统的回怒和贾诩的毒伤形成持续消耗。周泰消耗队则以不屈周泰为核心，搭配耀武华雄等防御型武将，通过高回复与减伤对抗持久战。此类阵容需根据敌方特性调整，例如面对爆发队时可增加控制型武将，而对抗消耗队时需强化输出效率。
武将培养优先级需遵循核心输出＞控制＞辅助＞坦克的原则。马超、吕布等主C角色需优先升星并强化装备，而左慈、貂蝉等控制型武将应注重速度属性。治疗类角色如华佗、大乔需提升生存能力以确保持续发挥作用。战魂搭配上，输出位选择破军或狂暴，控制位推荐控制大师，坦克则优先不动如山。羁绊激活可提升15%-30%基础属性，需通过阵营混搭或特定武将组合实现。
