新增战役挑战是提升战力的核心内容之一。根据游戏更新内容，后期开放的战役主要包括名将列传、神兽秘境、无双试炼、讨伐巨兽等高阶副本，这些副本不仅提供稀有道具如锁子黄金甲，还能通过通关解锁名将觉醒材料，大幅提升武将实力。名将列传作为剧情向副本，需完成主线任务后逐步解锁，而神兽秘境则考验玩家对阵容搭配和神兽培养的理解。
战役挑战的难度设计具有明显的阶梯性，例如无双试炼采用车轮战机制，怪物血量会继承，要求玩家合理规划阵容续航能力。讨伐巨兽作为团队副本，需2人组队参与，奖励包含兵符碎片和神兽装备强化材料。游戏定期推出的限时活动如黄巾之战也包含200关以上的高难度挑战，通关后可获得士兵强化书等专属资源，挂机收益随关卡进度提升而增加。
后期战役的奖励机制与玩家养成深度绑定。名将来袭活动掉落的天金兵符碎片箱、八阵图等紫金神兵，能显著提升队伍输出和生存能力。兵符系统需通过升星和强化来激活合击技能，而神兽装备则需通过秘境副本积累材料进行锻造。部分副本如灵山问道存在排行榜机制，赛季结算时会根据排名发放额外奖励，包括虹金武将碎片和灵契养成资源。
对于追求策略深度的玩家，后期战役还引入了元素变身机制。例如赤金夏侯渊、千幻左慈等武将可在战斗中触发变身状态，满血复活并强化技能效果，这要求玩家在阵容搭配时兼顾爆发与续航。沙盘推演、兵临城下等军团副本需要协同作战，通过占星盘积累和战术配合来攻克多层防御。游戏通过这类设计平衡了个人操作与团队协作的体验。
少年三国志2的后期战役内容覆盖了PVE、PVP和GVG多种模式，更新频率保持在每月1-2次大型活动。玩家需根据自身战力选择优先级，例如优先完成每日必刷的精英副本和列传扫荡，再逐步攻略高难度的跨服挑战。合理分配体力与元宝资源，结合版本趋势调整养成方向，是持续突破战役挑战的关键。
